USB 메모리와 USB 메모리 형태의 SSD는 모두 USB에 꽂아 데이터를 전송하며, 낸드 플래시에 데이터를 저장합니다. 

하지만 컨트롤러는 다릅니다. USB 메모리는 낸드 플래시를 직접 USB에 읽고 쓰는 프로토콜로 변환하는 게 대부분이며(개중에는 마이크로 SD 메모리카드를 쓰는 경우도 있음), USB SSD는 SATA나 NVMe SSD에 변환 컨트롤러를 장착해 USB에 연결합니다. 

USB 메모리는 컴퓨터 사이의 파일 교환을 위해 만든 것이기에 윈도우에서 이동식 디스크로 인식합니다. 따라서 윈도우의 디스크 관리에선 드라이브 문자 변경과 분리만 가능합니다. 또 GPT나 동적 디스크로 변환은 불가능합니다. 하지만 USB 메모리 형태의 SSD는 로컬 디스크처럼 인식하며 내장 SSD처럼 GPT나 동적 디스크 변환에 파티션 작업까지 가능합니다.